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摘要：现代南亚DNA和哈拉帕基因都含有古代伊朗DNA和少量东南亚狩猎采集者血统的混合体。是古代DNA研究中分析的骨骼，与典型的印度河流域文明墓葬相关，说明了IVC墓葬的典型南北走向。早期的DNA研究似乎证实了这一观点，因为今天的南亚人有着重要的伊朗血统。
在公元前几千年，大约5000年前开始，伟大的文明在欧亚大陆和北非繁荣昌盛。中东美索不达米亚和苏美尔的古代社会是最早介绍文字历史的社会之一；埃及的旧、中、新王国建立了复杂的宗教和社会结构；夏、商、周王朝统治着中国不断进步的社区和技术。但另一种鲜为人知的文明盛行于印度河流域，横跨现代阿富汗和巴基斯坦的大部分地区，并进入印度西北部地区。
这一印度河流域文明（IVC），也被称为哈拉帕文明，是在巴基斯坦的一处考古遗址之后，一直笼罩在神秘之中，主要是因为学者们还没有弄清楚哈拉帕语的含义，哈拉帕语由支离破碎的符号、图画和其他文字组成。考古学证据让研究人员对哈拉帕人的日常生活有了一定的了解，但由于湿热地区的遗传物质恶化，科学家们一直在努力拼凑IVC中来自远古DNA的证据，直到现在，
还是第一次，科学家们对一个人的基因组进行了测序从公元前2600年到1900年，在今天的印巴边境地区达到顶峰的哈拉帕文明或印度河流域文明，在一个4500年前的墓地中，一位妇女的微量DNA，从古代的骨骼遗骸中艰难地找到，给了研究者一扇进入世界上最古老文明之一的窗户。这项工作，连同对整个欧亚大陆古代DNA的全面分析，也对南亚农业的起源提出了新的问题。
在《细胞》杂志上对古代哈拉帕基因组进行了测序和描述，并与现代南亚人的DNA进行了比较，揭示了IVC人是大多数印第安人的祖先。现代南亚DNA和哈拉帕基因都含有古代伊朗DNA和少量东南亚狩猎采集者血统的混合体。”哈佛医学院遗传学家、合著者大卫·里奇在一份声明中说：“在体外受精个体中，这样的祖先是当今南亚的主要祖先来源。”。“这一发现将今天南亚的人们直接与印度河流域文明联系在一起。”
是古代DNA研究中分析的骨骼，与典型的印度河流域文明墓葬相关，说明了IVC墓葬的典型南北走向。（Vasant Shinde/Deccan学院研究生院）基因组也有一些惊喜。从当代东欧到蒙古，草原牧民遍布欧亚大陆广大草原，他们与草原牧民的遗传关系在南亚以及欧洲和整个欧洲大陆的其他人中无处不在。但是在古印度河流域的个体中没有草原牧民的DNA，这表明这些游牧牧民和现代族群之间的相似性是由于IVC衰落后的迁徙而产生的。
这些发现影响了印欧语系如何以及何时在古代世界广泛传播的理论。虽然现代南亚人和早期伊朗农民的共同祖先助长了农业从中东肥沃的新月地带迁移到印巴地区的想法，但古老的哈拉帕基因却没有显示出这种血统的贡献，这表明农业是通过思想交流而传播的，而不是而不是大规模的迁移，甚至可能是在南亚独立出现的。
“几十年来进行的考古学和语言学工作确实是我们研究过程中的前沿，”哈佛大学基因组学家、这项新研究的合著者Vagheesh Narasimhan说。“这些项目为这一过程带来了一系列新的基因证据，试图证明人类活动作为一部分可能产生的影响在农业和语言这两大文化变革中，
这个计划周密的大城市包括下水道和供水系统，以及延伸至美索不达米亚的远距离贸易网络。但是，尽管它曾经辉煌过，直到1921年哈拉帕的发掘工作开始揭开一座古城的面纱，现代研究人员才知道这个文明。从那以后，哈拉帕人一直保持着某种神秘感，留下了大量的城市废墟和一种神秘的符号和绘画语言，但很少有其他线索表明他们的身份。最终降临哈拉帕文明的原因也不清楚，尽管气候的变化被认为是其衰落的一部分。
这张地图描绘了印度河流域文明（IVC）的地理跨度，显示了Rakhigarhi（蓝色）和其他重要IVC遗址（红色）的位置，以及从其他考古文化（其他颜色）到北部和西部的遗址。黄色标签显示了两个地点，在那里少数埋葬的个体产生了与Rakhigarhi个体相匹配的古代DNA。（Vasant Shinde/Deccan学院研究生院）科学家在南亚恢复古代DNA有一段众所周知的困难时期，那里的亚热带气候通常使基因保存变得不可能。从位于现代印度哈里亚纳邦的哈拉帕人最大城市拉基加尔希（Rakhigarhi）墓地发现的遗骸中提取基因组，需要花费大量时间。科学家们从61个骨骼样本中采集了粉末，但只有一个样本含有微量的古代DNA。这个样本被尽可能地测序，产生100个不同的DNA片段 ... ，称为库，每一个都太不完整，无法进行自己的分析，但我们很幸运，它产生了足够的DNA，然后进行高分辨率群体遗传学分析，”纳拉西姆汉说。“我认为，这篇论文是一个技术上的成功案例，”他补充道，并指出该 ... 有望在其他具有挑战性的地区获得DNA。
单个样本并不代表曾经包括一百万或更多人的广泛人群，但今天发表在《科学》杂志上的一项相关研究提供了更广泛的地区背景。包括纳拉西姆汉和帝国在内的几位同一作者，以及数十位国际合作者，撰写了迄今为止发表的最大规模的古代DNA研究报告。在来自523个古代人类的基因序列中，来自遥远的亚欧大陆草原、伊朗东部和斯瓦特山谷现代巴基斯坦的铁器时代的人。“KDSPE”“KDSPs”团队发现，在许多基因相似的个体中，有少数离群点存在，它们的祖先类型与周围的物种完全不同。他们。
在伊朗和土库曼斯坦的遗址中发现的11个这样的个体可能与哈拉帕文明有关。事实上，这些离群的个体中有一些被埋葬在与南亚有文化联系的文物中，这加强了他们与IVC有联系的情况。
“这使得我们假设这些样本是 ... ，甚至可能是来自南亚的第一代 ... ，”Narasimhan说。来自Rakhigarhi的IVC基因组显示出与古代人类大规模研究中11个基因异常点的强烈遗传相似性，支持这些个体从哈拉帕文明冒险到中东的想法。“现在我们相信，这12个样本一起采集，大致代表了当时在（南亚）存在的祖先。”
这座位于哈萨克斯坦大理（约公元前1700年）的青铜时代中期墓葬在古代遭到抢劫，人类遗骸随意堆放在墓葬cist外。从这些遗骸中提取的DNA有助于追踪草原祖先从公元前2000年到公元前1500年向印度东部和南部的传播（迈克尔·弗拉切蒂）是农业研究的第一个证据早在公元前9500年，来自肥沃的新月，许多考古学家一直认为，种植农作物的做法是由 ... 从中东带到南亚的。早期的DNA研究似乎证实了这一观点，因为今天的南亚人有着重要的伊朗血统。
“我真的发现他们的分析非常令人兴奋，加州大学伯克利分校（UC Berkeley）的人口遗传学家Priya Moorjani说：“他们研究了伊朗不同时间尺度的古代DNA样本，并试图将南亚人的伊朗血统与这些不同群体的关系联系起来。不过，他们没有参与试管婴儿基因组的细胞研究。”，新的分析显示，肥沃新月的第一批农民似乎对南亚人口的遗传贡献不大。“然而，大约在公元前8000年左右，南亚也出现了类似的耕作方式，”南亚和中亚人口研究的共同作者Moorjani说。“随着我们获得更多古老的DNA，我们可以开始建立一个更详细的关于农业如何在世界各地传播的图片。我们正在学习，和其他一切一样，事情是非常复杂的。
如果农业确实从肥沃的新月传播到了现代印度，那么它很可能是通过思想和知识的交流传播的，这是一种文化转移，而不是伊朗西部农民自身的重大迁移。另一方面，在南亚，农业可以独立发展，因为在此期间，欧亚大陆许多地方的农业实践开始萌芽。
古老的IVC祖先也有其他谜团。这个文明是现代南亚人和铁器时代南亚人的最大来源人口，但它缺乏在后来时代常见的草原牧民血统。纳拉西姆汉说：“就像在欧洲，草原牧民的祖先直到青铜时代才出现一样，南亚也是如此。”。“因此，这一证据提供了有关这一祖先类型到达时间的信息，它们的运动与印欧语系的语言系统学相似，印欧语系的语言系统学今天在爱尔兰到新德里等地使用。”
作者认为印欧语系可能通过中亚到达南亚在公元前1000年上半叶的东欧，一种理论得到了一些遗传研究的证明，印伊语系和巴尔托斯拉夫语系之间的相似性。
Narasimhan希望更多的遗传数据能够帮助解开这个古老的谜团，特别是通过探索DNA与其他语系的发现相吻合或不同之处他说：
“我们正试图研究考古学文化与某一特定基因祖先的联系时间和方式，以及是否存在语言联系。”。“要理解人类历史，你真的需要整合这三条线。”“
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